В 2000-х годах основное внимание сотрудников лаборатории было направлено на оценку окультуренности почв по их физическому состоянию.

Обобщающей работой этих иследований являются методические рекомендации: Балашова Е.В., Моисеева К.Г. «Нормативы оценки оптимизации физических параметров почв, обеспечивающие совершенствование технологий возделывания с/х культур в полевых и регулируемых условиях».

В лаборатории развиваются традиционные направления исследований по агрофизическому обеспечению математических агроэкологических моделей.

 Итогом этих исследований явились:

во-первых,  свидетельство о государственной регистрации  базы  данных (№  2009620505, 2009 год) «База данных агрофизического состояния дерново-подзолистых супесчаных почв ГНУ Меньковская опытная станция и опытных полей  ГНУ Псковского научно-исследовательского института сельского хозяйства (ГНУ ПНИИСХ)", разработанное К.Г. Моисеевым  с соавторами

В лабораторных и полевых исследованиях сотрудники применяют современные методы измерения гидрофизических функций почв,  физических и физико-химических свойств почв, физического и компьютерного моделирования почвенных процессов и дистанционного оптического зондирования.

Важными направлениями исследований сотрудников лаборатории также являются: применение теории подобия к исследованию и моделированию природных процессов в почвах (К.Г. Моисеев), оценка эффективности агротехнологий по секвестрции органического углерода в почвах (Л. В. Бойцова), исследования и моделирование гидрофизических функций в почвах (В.Д. Гончаров).